本系以「發展學術前沿，在特定領域成為國內頂尖，進而成為能與國內外知名大學歷史系所合作與競爭的優秀學系」為發展目標；以「培養歷史教育、研究人才與文化工作者」為教育目標。依據大學部暨研究部之訓練標準與人才培育兩項考量，制訂三個層級如下：
(一)大學部：
1. 訓練標準
培養廣博的歷史知識，作為專業研究與跨領域學習之基礎。
2. 人才養成目標
(1) 培育未來的教師、研究者、檔案管理者、文史工作者及博物館工作者。
(2) 鼓勵學生發展多元專長，如：傳播、出版、圖書管理、文化產業等。
(二)研究部碩士班
1. 訓練標準
培養歷史學研究之進階能力。
2. 人才養成目標
(1) 培育中等教育師資和文化產業人才。
(2) 為進入博士課程預作知識訓練準備。
(三)研究部博士班:
1. 訓練標準
培養獨立研究與批判思考之能力。
2. 人才養成目標
(1) 培育未來高等教育師資及學術研究人才。
(2) 培育社會文化領域意見領袖與知識菁英。
本系既以培養歷史教育、研究人才與文史工作者為主要目標，將持續網羅優良師資、安排特色課程以及提昇研究風氣，以造就更多「通古今之變」的人才。大學部強調基礎知識與史學方法的訓練，並鼓勵同學依自我興趣及能力修習輔系、雙主修、跨領域學程與第二外語，因應多元社會的挑戰；研究部著重專業知識與研究方法的精進，強化與國內外教學及研究機構之學術對話，培養更開闊的世界觀。
